Sommaire
3. Les calculs à partir du site en ligne BiostaTGV
Après avoir cliqué sur le bouton [Calculez], en bas de la fenêtre, apparaissent les résultats.
Ils sont donnés selon deux méthodes de calcul.
Ainsi dans cet exemple pour trouver un Odds Ratio significatif de 3,5, avec un risque de première espèce de 5%, une puissance de 80%, et un groupe témoin trois fois plus grand que le groupe de cas, il faut 208 sujets au total (soit 52 cas et 156 témoins) selon la méthode du Chi-Deux, l'autre méthode (venant du paquet du logiciel R, "Epicalc") donnant le même résultat ici..
Trois paramètres au moins sont alors à saisir :
1) la valeur de l'Odds Ratio que l'on veut mettre en évidence;
2) la proportion attendue de témoins exposés;
3) le nombre de témoins par cas (le rapport de taille entre le groupe cas et le groupe témoin);
4) on peut modifier le risque de première espèce et la puissance voulue pour notre test (ici ils sont de 0,05 et de 0,8 respectivement).
Dans ce cas, le calcul s'effectue à partir de l'option [Etudes Cas-Témoins] de l'écran d'accueil de BiostaTGV.
Il apparait alors une nouvelle fenêtre.
Après avoir cliqué sur le bouton [Calculez], en bas de la fenêtre, apparaissent les résultats.
Ils sont donnés selon deux méthodes de calcul.
Ainsi dans cet exemple pour trouver une différence significative entre une prévalence de 0,08 et une de 0,22, avec un risque de première espèce de 5% et une puissance de 90%, il faut 258 sujets selon la méthode avec l'approximation Arcsin, ou 270 sujets au total, selon l'autre méthode (paquet du logiciel R, "epiR").
Remarque:
BiostaTGV donnera une estimation pour des groupes de même taille, il n'est pas possible d'indiquer qu'un groupe doit avoir plus de sujets qu'un autre.
Trois paramètres au moins sont alors à saisir :
1) le type de comparaison, ici deux proportions observées;
2) la proportion observée dans le premier groupe;
3) la proportion observée dans le deuxième groupe;
4) on peut modifier le risque de première espèce et la puissance voulue pour notre test (par défaut ils sont de 0,05 et de 0,9 respectivement).
Dans ce cas, le calcul s'effectue à partir de l'option [Comparer deux proportions binomiales] de l'écran d'accueil de BiostaTGV.
Il apparait alors une nouvelle fenêtre.
Après avoir cliqué sur le bouton [Calculez], en bas de la fenêtre, apparaissent les résultats.
Ils sont donnés selon deux méthodes de calcul.
Ainsi dans cet exemple pour trouver une différence significative entre une prévalence théorique de 0,08 et une prévalence observée de 0,22, avec un risque de première espèce de 5% et une puissance de 90%, il faut 58 sujets.
3.4 Calcul du Nombre de sujets nécessaire dans le cas de la comparaison de prévalences, en entrant l'Odds Ratio (enquête cas-témoin)
3.3 Nombre de sujets nécessaire dans le cas de la comparaison de deux prévalences observées.
3.2 Nombre de sujets nécessaire dans le cas de la comparaison d'une prévalence observée avec une prévalence théorique
3.1 Nombre de sujets nécessaire dans le cas de la comparaison de moyennes
3. Le calcul du nombre de sujets nécessaire à partir du site en ligne BiostaTGV
Trois paramètres au moins sont alors à saisir :
1) le type de comparaison, ici avec une proportion théorique;
2) la proportion théorique;
3) la proportion observée (à comparer avec celle théorique);
4) on peut modifier le risque de première espèce et la puissance voulue pour notre test (par défaut ils sont de 0,05 et de 0,9 respectivement).
Dans ce cas, le calcul s'effectue à partir de l'option [Comparer deux proportions binomiales] de l'écran d'accueil de BiostaTGV.
Il apparait alors une nouvelle fenêtre.
Après avoir cliqué sur le bouton [Calculez], en bas de la fenêtre, apparaissent les résultats.
Ainsi dans cet exemple pour trouver une différence significative entre les moyennes 150 et 120, avec un écart type de 20, pour un risque de première espèce de 5% et une puissance de 90%, il faut 20 sujets au total, soit 10 par groupe.
Trois paramètres sont alors à saisir :
1) la moyenne dans le premier groupe;
2) la moyenne dans le deuxième groupe à comparer au premier;
3) une estimation de l'écart type de la moyenne commun au deux groupes.
4) On peut aussi saisir le risque de première espèce et la puissance désirée pour notre test (habituellement on prend les valeurs de 0,05 et de 90 %).
Dans le cas de la comparaison de deux moyennes, le calcul s'effectue à partir de l'option [Comparer deux moyennes] de l'écran d'accueil de BiostaTGV.
Il apparait alors une nouvelle fenêtre:
Comparaison de 2 prévalences dans les enquêtes de cohorte (à partir les valeurs des 2 prévalences) ou comparaison d'une prévalence observée avec une prévalence théorique.
==> la comparaison de deux moyennes
Ecran d'accueil du site BiostaTGV avec les différentes options de calcul du nombre de sujets nécessaires:
Article publié le 3 janvier 2024
Calcul du nombre de sujets nécessaire dans une enquête (3/4)
